أثارت الانتهاكات التي ترتكبها القوات الحكومية والمليشيات الطائفية ضد مدنيين من خلال دفنهم أحياء حفيظة منظمات حقوقية عدة، إذ دعت «هيومن رايتس ووتش» حكومة حيدر العبادي إلى إجراء تحقيق بتقارير وأد النازحين خلال عملية ما يسمى «استعادة مدينة الفلوجة وتحريرها». في حين قال شيوخ عشائر إن مئات المعتقلين لا تزال مصائرهم مجهولة، بينما كشف فيديو انتشر على وسائل التواصل الاجتماعي مشاركة عناصر من الحرس الثوري الإيراني في المعركة، أحدهم ممسك بهاتفه النقال ويتحدث بالفارسية قائلاً: «نحن في ظهر الجمعة، وهذه عمليات تحرير الفلوجة، أنا إيراني».