فيما يلي، أهم الملاحظات الواردة في تقرير ديوان الرقابة المالية والإدارية عن وزارة الصحة والمخالفات التي تم رصدها:

• تكليف قسم مكافحة العدوى بمتابعة مراقبة وفرز المخلفات المعدية فقط .
• الصحة تتعاقد مع مستشفى لمعالجة المخالفات الصحية لانخفاض التكلفة من 210 فلس إلى 115 فلس للكيلوجرام، دون دراسة ملائمتها طريقة التعقيم.
• التخلص من مخلفات الأدوية المنتهية والتالفة عن طريق تعقيمها بالمستشفى، بدلاً من حرقها.
• تكدس حوالي 510 ليترمن المخلفات الكيميائية بوزارة الصحة، أثر تأخرها عن ابرام عقد للتخلص من المخلفات.
• مدفن حفيرة لم يستلم كميات من مخلفات عالية الخطورة التي انتجتها الصحة خلال يناير 2013 حتى ابريل 2016.
• التخلص من المخلفات عالية الخطورة في مدفن عسكر مع المخلفات الصحية الاخرى.
• مجمع السلمانية يتخلص من المخلفات السائلة الناتجة من تحليل عينات الدم والمحاليل كيمائية خطرة القابلة للاشتعال
في شبكة الصرف الصحي.
• بيع حاويات المادة المشعة إلى تجار الخردة في مزايدات داخلية.