بعد تلقيه زوجاً من الأحذية الرياضية وهو في عمر السادسة، بدأ زلاتان إبراهيموفيتش بالتنقل بين أندية الناشئين مثل نادي روزينغراد لكرة القدم وإف بي كي بلقان، صرح زلاتان في إحدى المقابلات، بأن فريقه ذات مرة، كان متأخراً بنتيجة 4-0 حتى نهاية الشوط الأول، فأدخله المدرب كبديل، ليسجل في تلك المباراة ثمانية أهداف بشكل لا يصدق. بالرغم من أن زلاتان كان أحد ركائز نادي مالمو خلال سنوات المراهقة الأولى، إلا أنه كان سيضطر للخروج من النادي في سن الخامسة عشرة للعمل في ميناء مالمو، لكن المدرب أقنعه بالبقاء في النادي، أكمل إبراهيموفيتش سنوات المدرسة الإعدادية بنجاح عند الصف التاسع. بالرغم من أنه كان موافقاً على بقائه في مدرسة مالمو بورغاسكولا، وعلاماته كانت أعلى من المعدل، إلا أنه اضطر للخروج من المدرسة، للتركيز على مسيرته الرياضية، لعب زلاتان إبراهيموفتش لنادي مالمو السويدي في دوري الدرجه الثانية في سن التاسعة عشر، بعد أول موسم له مع الفريق وتسجيل 19 هدفاً والأداء الرائع، عرضت 3 نوادي شراء إبرا هم (آرسنال - أياكس امستردام - روما الإيطالي)، واختار إبرا اللعب في صفوف نادي أياكس، لعب في أياكس 4 مواسم ثم انتقل للعب في الدوري الإيطالي في نادي يوفنتوس، وبعد موسمين انتقل لنادي إنتر ميلان، لعب لصالح نادي إنتر ميلان 3 مواسم سجل فيها 57 هدفاً، ثم انتقل لنادي برشلونة بصفقه تعد ثاني أغلى صفقة في تاريخ كرة القدم بعد كرستيانو رونالدو، حيث تم استبدال إبرا بإيتو لاعب برشلونة بالإضافة لثلاثين مليون يورو، بسبب الخلافات مع جوارديولا، رحل إبرا عن برشلونة إلى نادي إيه سي ميلان لمدة أربع سنوات بقيمة 24 مليون يورو، وقد سجل في موسمه الأول مع ميلان 23 هدفاً، وفي الموسم الثاني سجل 28 هدفاً ليكون هداف الدوري الإيطالي موسم 2011-2012 وثالث هداف في تاريخ النادي.