أجريت قرعة مسابقات الكؤوس للفئات السنية للموسم الرياضي 2011/2012 في بيت الكرة البحرينية بالرفاع مساء يوم الثلاثاء الموافق 20 مارس 2012، بحضور 11 من ممثلي الأندية المنضوية تحت مظلة الاتحاد البحريني لكرة القدم وهي الأهلي، المحرق، الحالة، البحرين، الرفاع، الرفاع الشرقي، البديع، المنامة، النجمة، سترة والمالكية. وغياب 8 من ممثلي أندية كل من الحد، الشباب، الاتحاد، البسيتين، مدينة عيسى، الاتفاق، التضامن وقلالي. في بداية الاجتماع تحدث القائم بأعمال الأمين العام علي البوعينين مهنئاً فرق الصدارة لدوري الفئات ومتمنياً لباقي الفرق تحقيق نتائج ايجابية في مسابقات الكؤوس للفئات السنية للموسم الرياضي 2011/2012. قام بعدها رئيس قسم المسابقات بالاتحاد حسن إسماعيل بتقديم شرح تفصيلي عن نظام مسابقات الكؤوس لجميع الفئات السنية للموسم الرياضي 2011/2012 . وأسفرت القرعة للدور التمهيدي لمسابقة كأس الشباب بلقاء يجمع المحرق مع قلالي والمنامة مع الحالة والبحرين مع سترة. وفي دور ال16 يلتقي المالكية مع مدينة عيسى والبسيتين مع الأهلي والفائز من مباراة المحرق وقلالي مع الرفاع والشباب سيلاقي التضامن. وفي المجموعة الثانية سيلتقي البديع مع الاتفاق والحد مع الاتحاد والفائز من المنامة والحالة سيلاقي الرفاع الشرقي الفائز من البحرين وسترة سيلاقي النجمة. بعدها سحبت قرعة مسابقة كأس الناشئين وأسفرت عن لقاء التضامن والرفاع والبديع مع الحالة وقلالي مع المالكية في الأدوار التمهيدية بينما ستجمع مباريات المجموعة الأُولى في دور الـ16 فريقي مدينة عيسى والرفاع الشرقي والأهلي سيلاعب سترة والشباب سيلاقي المحرق والحد سيلاعب الفائز من لقاء التضامن والرفاع. وفي المجموعة الثانية سيلتقي المنامة مع الاتحاد والنجمة مع البحرين والاتفاق مع البسيتين والفائز من لقاء قلالي والمالكية سيلاعب الفائز من مباراة البديع والحالة. وأسفرت قرعة كأس الأشبال عن لقاءات ستجمع الحالة والنجمة والبديع مع الرفاع ومدينة عيسى مع سترة في الأدوار التمهيدية للمسابقة. وفي دور الـ16 سيلتقي الأهلي مع الرفاع الشرقي والشباب مع الفائز من الحالة والنجمة والتضامن مع قلالي والبحرين مع الفائز من لقاء البديع والرفاع. وفي المجموعة الثانية سيلتقي البسيتين مع الاتحاد والاتفاق مع المحرق والمنامة مع الحد والفائز من لقاء مدينة عيسى وسترة مع المالكية. واعتمد الاتحاد البحريني لكرة القدم موعد انطلاق الأدوار التمهيدية لكأس الشباب في 19 أبريل في حين ستنطلق الأدوار التمهيدية لكأس الناشئين في 17 أبريل، وستنطلق الأدوار التمهيدية لكأس الأشبال في 25 أبريل 2012. في حين حدد اتحاد الكرة 6 مايو 2012 ليكون موعداً للمباراة النهائية لمسابقة كأس الشباب. و8 مايو 2012 موعداً لنهائي كأس الناشئين و13 مايو 2012 موعداً للمباراة النهائية لمسابقة كأس الأشبال.