مما ورد في تقرير الرقابة المالية والإدارية 2012/2013 عن مخالفات في وزارة الصحة:

- وزارة الصحة لم تتخذ إجراءات ضد شركات متخلفة عن سداد ذمم مالية يصل مجموعها 10 مليون دينار

- الصحة غيرت مشرفي مخازن دون إجراء الجرد اللازم لذلك

- 1.2 مليون دينار قيمة الفرق بين الأدوية الموجودة فعليا والمقيدة في النظام الألكتروني للصحة

- 1.4 مليون دينار قيمة الفرق بين الأدوية المقيدة في نظامي وزارة الصحة الالكترونيين

- وزارة الصحة تصرف 7% فقط من ميزانية المشروعات

- مشاريع "حبر على ورق" في وزارة الصحة لسنوات رغم تخصيص الميزانية

- "الصحة" تعفي مؤسسات غير مستوفية للشروط من مبالغ "الرعاية الصحية الأولية"

- صرف مبالغ زائدة بنسبة وصلت لـ 35% لموظفين تمت ترقيتهم مؤخرا

- "الصحة" تخصم 4 أضعاف مبالغ التأمين الاجتماعي الحقيقي لبعض الموظفين